Travailler avec R Markdown

Objectifs de la rencontre

• Comprendre les avantages de travailler avec R Markdown
• S'initier au language Markdown et R Markdown
• Créer un fichier R Markdown (.Rmd), aliant à la fois textes et codes
• Transformer le fichier créé en document HTML/PDF

Ce document a justement été créé avec R Markdown!

R Markdown permet de créer des documents où des sections de texte et de code sont intercallés, ce qui facilite le travail et la collaboration en science. Adieu les copier-coller entre la console R et un document Word!!!

# Jeu de donnée iris
head(iris, n=3L)

##   Sepal.Length Sepal.Width Petal.Length Petal.Width Species
## 1          5.1         3.5          1.4         0.2  setosa
## 2          4.9         3.0          1.4         0.2  setosa
## 3          4.7         3.2          1.3         0.2  setosa

# Créer un graphique
plot(iris$Sepal.Length, iris$Petal.Length, xlab = "Sepal Length", ylab = "Petal Length")

Pré-requis à la rencontre

Avoir un portable avec R installé, c'est tout!

Vous trouverez dans ce répertoire

• Les deux fichiers exemples utilisés lors de l'atelier
• Un lien vers la présentation utilisée lors de l'atelier du 31 janvier 2018