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Minutes tables rondes 2019

Martin Kilbinger edited this page Aug 23, 2019 · 27 revisions

Projet Weak-lensing shear bias

Tables Rondes, Euclid Banyuls 2019

Minutes

1re réunion, 20/09/2019

Olivier, Marion, Antonello, Axel, Martin.

Fait:

  • Martin a introduit le sujet à partir des slides de l'année dernière (Voir http://www.cosmostat.org/wp-content/uploads/2018/08/wl_tables_rondes.pdf) et le rapport de TR donné par Olivier l'année dernière (Voir).
  • Tous: regarder le papier Pujol et al. 2019, les codes python et notebooks
  • Martin a créé une branche pure_python de shear_bias sans shapelens qu'on peut installer facilement. Sur la VM EDE19, le mieux est de le faire dans un environment conda. Ca marche avec python2.

2me réunion, 22/09/2019

Olivier, Marion, Antonello, Axel, Martin.

Axel a réussi à installer shapelens (en stand-alone), et tourner le notebook sous la VM (avec python2).

Version pure python (pour le moment sans mesure de forme).

Pour installer toutes les libraries python, utiliser miniconda:

  • D'abord, installer conda en le téléchargant depuis https://docs.conda.io/en/latest/miniconda.html. Activer conda, et la commande python va lancer celle de conda, version 2.7:

    conda env create -f environment.yml

    (ca prend plusieures minutes...)

  • Next, installer la librairie shear_bias:

    git clone https://github.com/martinkilbinger/shear_bias.git
    cd shear_bias
    git checkout pure_python
    python setup.py install --prefix /home/ede2019/miniconda3

    Avec cela, on devrait pouvoir tourner le jupyter notebook jusqu'à la mesure de forme (shapelens).

Version complète.

  • Installer la version pure python (voir ci-dessous) mais avec la branche master.
  • Installer tmv
    cd tmv0.71
     sudo apt install scons
    scons
    scons install
    cd ..
  • Installer tlcap
    wget https://sourceforge.net/projects/tclap/files/tclap-1.2.2.tar.gz
    tar xf tclap-1.2.2.tar.gz
    cd tclap-1.2.2
    ./configure
    make
    sudo make install
    cd ..
  • Installer cfitsio
    cd cfitsio-3.47
    make
    sudo make install
    cd ..
  • Installer boost
    # Sous linus
    sudo apt-get install libboost-all-dev
  • Installer shapelens
    cd shapelens
    rm -rf bin/get_shapes
    [sudo] make
    [sudo] make progs
    Rajouter shapelens/bin à la PATH dans ~/.bashrc.