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<h2 id="toc-title">Table of contents</h2>
<ul>
<li><a href="#bash-배치-파일-실행" id="toc-bash-배치-파일-실행" class="nav-link active" data-scroll-target="#bash-배치-파일-실행">1. BASH 배치 파일 실행</a>
<ul class="collapse">
<li><a href="#배치-파일-생성" id="toc-배치-파일-생성" class="nav-link" data-scroll-target="#배치-파일-생성">1.1 배치 파일 생성</a></li>
<li><a href="#배치-파일-실행" id="toc-배치-파일-실행" class="nav-link" data-scroll-target="#배치-파일-실행">1.2 배치 파일 실행</a></li>
</ul></li>
<li><a href="#jupyter-notebook-웹-실행" id="toc-jupyter-notebook-웹-실행" class="nav-link" data-scroll-target="#jupyter-notebook-웹-실행">2. Jupyter Notebook 웹 실행</a>
<ul class="collapse">
<li><a href="#배치-파일-생성-1" id="toc-배치-파일-생성-1" class="nav-link" data-scroll-target="#배치-파일-생성-1">2.1 배치 파일 생성</a></li>
<li><a href="#배치-파일-실행-1" id="toc-배치-파일-실행-1" class="nav-link" data-scroll-target="#배치-파일-실행-1">2.2 배치 파일 실행</a></li>
<li><a href="#포트-포워딩" id="toc-포트-포워딩" class="nav-link" data-scroll-target="#포트-포워딩">2.3 포트 포워딩</a></li>
<li><a href="#jupyter-notebook-로그인" id="toc-jupyter-notebook-로그인" class="nav-link" data-scroll-target="#jupyter-notebook-로그인">2.4 Jupyter Notebook 로그인</a></li>
<li><a href="#jupyter-notebook-작업-마치기" id="toc-jupyter-notebook-작업-마치기" class="nav-link" data-scroll-target="#jupyter-notebook-작업-마치기">2.5 Jupyter Notebook 작업 마치기</a></li>
</ul></li>
</ul>
</nav>
</div>
<!-- main -->
<main class="content" id="quarto-document-content">
<header id="title-block-header" class="quarto-title-block default">
<div class="quarto-title">
<h1 class="title"><span class="chapter-title">Chapter4. Python 실행</span></h1>
</div>
<div class="quarto-title-meta">
</div>
</header>
<p>Python을 실행하는 방법은 두 가지가 있습니다.</p>
<p>첫 번째는 Shell 파일을 이용하여 <strong>Python 배치 파일을 실행</strong>하는 방법입니다. 두 번째는 Shell 파일을 이용하여 <strong>Jupyter Notebook에 웹 접속 후, Python 파일을 실행</strong>하는 방법입니다.</p>
<p>두 방법 중 한 가지의 방법을 선택하셔서 실행하시면 됩니다.</p>
<section id="bash-배치-파일-실행" class="level2 unnumbered">
<h2 class="unnumbered anchored" data-anchor-id="bash-배치-파일-실행">1. BASH 배치 파일 실행</h2>
<p>Bash 창에서 배치 파일을 실행하여 파이썬 프로젝트를 실행할 수 있습니다.</p>
<p>작업(job) 실행 후, 최대 이틀 동안 실행 가능합니다. 시뮬레이션이나 실험을 진행함에 있어 시간이 더 걸릴 것으로 예상된다면 관리자 메일([email protected])에 문의하셔서 최대 진행되는 노드의 진행 시간을 더 늘릴 수 있습니다. 최대 진행 시간은 일주일입니다.</p>
<section id="배치-파일-생성" class="level3 unnumbered">
<h3 class="unnumbered anchored" data-anchor-id="배치-파일-생성">1.1 배치 파일 생성</h3>
<p>생성한 배치 파일의 내용은 아래와 같이 입력될 수 있습니다.</p>
<p>아래의 사항을 본인의 작업(job)에 맞게 입력한 후, 본인이 원하는 파일의 이름을 지정하여 <code>filename.sh</code> 형식으로 파일을 저장합니다. 예를 들어 아래의 Shell 파일을 <code>python_project.sh</code>로 저장합니다.</p>
<p>파일명이 <code>.sh</code> 형식인지 반드시 확인하세요.</p>
<div class="cell">
<div class="sourceCode cell-code" id="cb1"><pre class="sourceCode bash code-with-copy"><code class="sourceCode bash"><span id="cb1-1"><a href="#cb1-1" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="co">#!/bin/bash</span></span>
<span id="cb1-2"><a href="#cb1-2" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="co">#SBATCH --nodes=1 </span></span>
<span id="cb1-3"><a href="#cb1-3" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="co">#SBATCH --partition=gpu2 </span></span>
<span id="cb1-4"><a href="#cb1-4" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="co">#SBATCH --cpus-per-task=56 </span></span>
<span id="cb1-5"><a href="#cb1-5" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="co">#SBATCH --gres=gpu:4</span></span>
<span id="cb1-6"><a href="#cb1-6" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="co">#SBATCH --job-name=UBAIJOB </span></span>
<span id="cb1-7"><a href="#cb1-7" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="co">#SBATCH -o ./결과값 도출 지정 폴더 이름/jupyter.%N.%j.out # STDOUT </span></span>
<span id="cb1-8"><a href="#cb1-8" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="co">#SBATCH -e ./결과값 도출 지정 폴더 이름/jupyter.%N.%j.err # STDERR</span></span>
<span id="cb1-9"><a href="#cb1-9" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a></span>
<span id="cb1-10"><a href="#cb1-10" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="bu">echo</span> <span class="st">"start at:"</span> <span class="kw">`</span><span class="fu">date</span><span class="kw">`</span> </span>
<span id="cb1-11"><a href="#cb1-11" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="bu">echo</span> <span class="st">"node: </span><span class="va">$HOSTNAME</span><span class="st">"</span> </span>
<span id="cb1-12"><a href="#cb1-12" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="bu">echo</span> <span class="st">"jobid: </span><span class="va">$SLURM_JOB_ID</span><span class="st">"</span> </span>
<span id="cb1-13"><a href="#cb1-13" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a></span>
<span id="cb1-14"><a href="#cb1-14" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="ex">module</span> unload CUDA/11.2.2 </span>
<span id="cb1-15"><a href="#cb1-15" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="ex">module</span> load cuda/11.8.0</span>
<span id="cb1-16"><a href="#cb1-16" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a></span>
<span id="cb1-17"><a href="#cb1-17" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="ex">python</span> cnn.py 12 256 <span class="st">'relu'</span></span></code><button title="Copy to Clipboard" class="code-copy-button"><i class="bi"></i></button></pre></div>
</div>
<p>결과값 도출 지정 폴더 이름을 반드시 지정해주세요. 각각 결과 값 폴더를 따로따로 만들어주거나 아니면 동일 폴더에 지정하셔도 됩니다.</p>
<p>STDOUT은 결과 값 출력 파일, STDERR는 결과 값 도출 중 출력 되는 로그 파일입니다. 새 폴더를 만들기 위해서는 디렉토리(directory)에서 오른쪽 버튼을 눌러 새 폴더 만들기 버튼을 클릭하시면 됩니다.</p>
<p><br></p>
<p>각 라인들의 의미는 다음과 같습니다.</p>
<p>✔ <strong><code>#SBATCH --nodes=1</code></strong> 총 필요 노드 수를 지정하는 명령어이며, 노드는 자동으로 컴퓨터가 배정해줍니다. nodes=1은 노드를 한 개만 사용하겠다는 의미입니다.</p>
<p>✔ <strong><code>#SBATCH --partition=gpu4</code></strong> 사용할 Partition을 지정하는 명령어입니다. Partition 정보는 <strong>UBAI Cluster</strong> 페이지를 참고하세요.</p>
<p>✔ <strong><code>#SBATCH --cpus-per-task=14</code></strong> 총 필요 코어의 개수를 지정하는 명령어입니다. 노드는 n개의 코어를 가지며, 사용 노드 1개 당 몇 개의 CPU/GPU 코어를 쓸 것인지를 결정합니다. #of Cores/node 정보는 Partition 정보에서 확인할 수 있습니다. <strong>UBAI Cluster</strong> 페이지를 참고하세요.</p>
<p>✔ <strong><code>#SBATCH --gres=gpu:1</code></strong> 몇 개의 GPU를 사용할 것인지 지정하는 명령어입니다. CPU Partition을 선택하신 경우 해당 코드는 지워주셔야 합니다. 해당 코드는 GPU의 개수를 지정하는 명령어이기에, 에러가 발생할 수 있습니다.</p>
<p>✔ <strong><code>#SBATCH --job-name=UBAIJOB</code></strong> 작업 이름을 지정하는 명령어입니다.</p>
<p>✔ <strong><code>echo "start at:" 'date'</code></strong> 접속 날짜가 표기됩니다.</p>
<p>✔ <strong><code>echo "node: $HOSTNAME"</code></strong> 접속한 노드 번호가 표기됩니다.</p>
<p>✔ <strong><code>echo "jobid: $SLURM_JOB_ID"</code></strong> jobid가 표기됩니다.</p>
<p>✔ <strong><code>module ~</code></strong> 원하는 Linux 환경을 구축할 수 있습니다. GPU 환경을 사용하고 싶은 경우에만 해당하며, GPU 환경을 사용하지 않을 경우(CPU Partition 사용) 지우셔도 무관합니다. Chapter3. 환경 구축에서 설명한 module envrionment에 해당합니다. 자세한 설명은 해당 파트에서 확인하세요.</p>
<p>✔ <strong><code>python cnn.py 12 256 'relu'</code></strong> 원하는 Python 파일을 실행합니다. 실행하려는 파일은 반드시 <code>.py</code>파일의 형태로 존재해야합니다. 위 코드에는 <code>cnn.py</code>로 지정하였습니다. Python의 sys 패키지를 이용한 <code>sys.argv</code>로 매개변수를 이용한 실행 방법을 사용하였습니다. 자세한 사항은 sys의 <a href="https://docs.python.org/3/library/sys.html">공식문서</a>에서 확인할 수 있습니다. 파라미터 없이 모델을 실행하고 싶은 경우에는 <code>python {filename}.py</code>로 실행할 수 있습니다.</p>
</section>
<section id="배치-파일-실행" class="level3 unnumbered">
<h3 class="unnumbered anchored" data-anchor-id="배치-파일-실행">1.2 배치 파일 실행</h3>
<p>배치 파일을 실행하기에 앞서, 본인이 생성했던 Python 가상 환경에 들어와 있는 상태인지 재 확인합니다.</p>
<p>이후, terminal에 <code>sbatch</code> 명령어를 이용하여 지정한 배치 파일명을 입력 및 실행하세요. 이는 작업(job)을 제출한다는 의미입니다.</p>
<p>실행 후 나온 결과 값은 작업(job)에 대한 ID이니 꼭 따로 저장하거나 메모해두시기를 요청드립니다.</p>
<div class="cell">
<div class="sourceCode cell-code" id="cb2"><pre class="sourceCode bash code-with-copy"><code class="sourceCode bash"><span id="cb2-1"><a href="#cb2-1" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="ex">sbatch</span> filename.sh <span class="co"># ex) sbatch python_project.sh </span></span></code><button title="Copy to Clipboard" class="code-copy-button"><i class="bi"></i></button></pre></div>
</div>
<div style="font-size: 13px;">
※ <em>예시코드인 cnn.py를 정상적으로 실행하기 위해서는 추가 패키지 설치 <code>pip install tensorflow && pip install numpy</code>가 필요합니다.</em>
</div>
<p><br></p>
<p>작업(job) 제출이 정상적으로 진행되었다면, STDOUT폴더 안에 OUT 파일이 생성됩니다.</p>
<p>만일 OUT파일이 생성되지 않았다면, 해당 Partition의 노드에 기존 작업(job)이 모두 할당되어 수행하지 못했을 가능성이 높습니다. 이 경우 terminal에 <code>squeue</code> 명령어를 입력하시고, 본인의 ID를 찾습니다.</p>
<p>보통 배정이 되어있다면 정상적으로 n001, n002 … 으로 노드에 배정되어 있지만, 배정되지 않았을 경우 ( <em>Resources, Priority</em> )라는 메시지를 볼 수 있습니다. 그런 경우 다른 노드가 일이 끝나는 것을 기다리거나, 해당 파티션이 아닌 다른 파티션을 이용하여 노드를 배정받아야 합니다.</p>
<p>다른 파티션을 이용하기 위해서는 Partition 목록에서 Partition과 cpus-per-task, gpu 갯수를 Partition에 맞게 수정하여 작업(job)을 다시 제출하셔야 합니다.</p>
<p>이제 STDOUT폴더에 생성된 실행 결과 OUT파일을 확인할 수 있습니다.</p>
<p><img src="./jpg/cnn.jpg" class="img-fluid"></p>
</section>
</section>
<section id="jupyter-notebook-웹-실행" class="level2 unnumbered">
<h2 class="unnumbered anchored" data-anchor-id="jupyter-notebook-웹-실행">2. Jupyter Notebook 웹 실행</h2>
<p>Jupyter notebook을 웹에서 실행하여 파이썬 프로젝트를 실행할 수 있습니다.</p>
<p>작업(job) 실행 후, 최대 이틀 동안 실행 가능합니다. 시뮬레이션이나 실험을 진행함에 있어 시간이 더 걸릴 것으로 예상된다면 관리자 메일([email protected])에 문의하셔서 최대 진행되는 노드의 진행 시간을 더 늘릴 수 있습니다.</p>
<p>최대 진행 시간은 일주일입니다.</p>
<section id="배치-파일-생성-1" class="level3 unnumbered">
<h3 class="unnumbered anchored" data-anchor-id="배치-파일-생성-1">2.1 배치 파일 생성</h3>
<p>생성한 배치 파일의 내용은 아래와 같이 입력될 수 있습니다.</p>
<p>아래의 사항을 본인의 작업(job)에 맞게 입력한 후, 본인이 원하는 파일의 이름을 지정하여 <code>filename.sh</code> 형식으로 파일을 저장합니다. 예를 들어 아래의 Shell 파일을 <code>jupyter_notebook.sh</code>로 저장합니다.</p>
<p>파일명이 <code>.sh</code> 형식인지 반드시 확인하세요.</p>
<div class="cell">
<div class="sourceCode cell-code" id="cb3"><pre class="sourceCode bash code-with-copy"><code class="sourceCode bash"><span id="cb3-1"><a href="#cb3-1" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="co">#!/bin/bash</span></span>
<span id="cb3-2"><a href="#cb3-2" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="co">#SBATCH --nodes=1 </span></span>
<span id="cb3-3"><a href="#cb3-3" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="co">#SBATCH --partition=gpu4 </span></span>
<span id="cb3-4"><a href="#cb3-4" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="co">#SBATCH --cpus-per-task=14 </span></span>
<span id="cb3-5"><a href="#cb3-5" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="co">#SBATCH --gres=gpu:1 </span></span>
<span id="cb3-6"><a href="#cb3-6" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="co">#SBATCH --job-name=UBAIJOB</span></span>
<span id="cb3-7"><a href="#cb3-7" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="co">#SBATCH -o ./결과값 도출 지정 폴더 이름/jupyter.%N.%j.out # STDOUT </span></span>
<span id="cb3-8"><a href="#cb3-8" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="co">#SBATCH -e ./결과값 도출 지정 폴더 이름/jupyter.%N.%j.err # STDERR </span></span>
<span id="cb3-9"><a href="#cb3-9" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a></span>
<span id="cb3-10"><a href="#cb3-10" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="bu">echo</span> <span class="st">"start at:"</span> <span class="kw">`</span><span class="fu">date</span><span class="kw">`</span></span>
<span id="cb3-11"><a href="#cb3-11" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="bu">echo</span> <span class="st">"node: </span><span class="va">$HOSTNAME</span><span class="st">"</span> </span>
<span id="cb3-12"><a href="#cb3-12" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="bu">echo</span> <span class="st">"jobid: </span><span class="va">$SLURM_JOB_ID</span><span class="st">"</span> </span>
<span id="cb3-13"><a href="#cb3-13" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a></span>
<span id="cb3-14"><a href="#cb3-14" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="ex">module</span> unload CUDA/11.2.2 </span>
<span id="cb3-15"><a href="#cb3-15" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="ex">module</span> load cuda/11.8.0 </span>
<span id="cb3-16"><a href="#cb3-16" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a></span>
<span id="cb3-17"><a href="#cb3-17" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="ex">python</span> <span class="at">-m</span> jupyter lab <span class="va">$HOME</span> <span class="dt">\</span></span>
<span id="cb3-18"><a href="#cb3-18" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a> <span class="at">--ip</span><span class="op">=</span>0.0.0.0 <span class="dt">\</span></span>
<span id="cb3-19"><a href="#cb3-19" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a> <span class="at">--no-browser</span></span></code><button title="Copy to Clipboard" class="code-copy-button"><i class="bi"></i></button></pre></div>
</div>
<p>결과값 도출 지정 폴더 이름을 반드시 지정해주세요. 각각 결과 값 폴더를 따로따로 만들어주거나 아니면 동일 폴더에 지정하셔도 됩니다.</p>
<p>STDOUT은 결과 값 출력 파일, STDERR는 결과 값 도출 중 출력 되는 로그 파일입니다. 새 폴더를 만들기 위해서는 디렉토리(directory)에서 오른쪽 버튼을 눌러 새 폴더 만들기 버튼을 클릭하시면 됩니다.</p>
<p>각 라인들의 의미는 다음과 같습니다.</p>
<p>✔ <strong><code>#SBATCH --nodes=1</code></strong> 총 필요 노드 수를 지정하는 명령어이며, 노드는 자동으로 컴퓨터가 배정해줍니다. nodes=1은 노드를 한 개만 사용하겠다는 의미입니다.</p>
<p>✔ <strong><code>#SBATCH --partition=gpu4</code></strong> 사용할 Partition을 지정하는 명령어입니다. Partition 정보는 UBAI Cluster 페이지를 참고하세요.</p>
<p>✔ <strong><code>#SBATCH --cpus-per-task=14</code></strong> 총 필요 코어의 개수를 지정하는 명령어입니다. 노드는 n개의 코어를 가지며, 사용 노드 1개 당 몇 개의 CPU/GPU 코어를 쓸 것인지를 결정합니다. #of Cores/node 정보는 Partition 정보에서 확인할 수 있습니다. UBAI Cluster 페이지를 참고하세요.</p>
<p>✔ <strong><code>#SBATCH --gres=gpu:1</code></strong> 몇 개의 GPU를 사용할 것인지 지정하는 명령어입니다. CPU Partition을 선택하신 경우 해당 코드는 지워주셔야 합니다. 해당 코드는 GPU의 개수를 지정하는 명령어이기에, 에러가 발생할 수 있습니다.</p>
<p>✔ <strong><code>#SBATCH --job-name=UBAIJOB</code></strong> 작업 이름을 지정하는 명령어입니다.</p>
<p>✔ <strong><code>echo "start at:" 'date'</code></strong> 접속 날짜가 표기됩니다.</p>
<p>✔ <strong><code>echo "node: $HOSTNAME"</code></strong> 접속한 노드 번호가 표기됩니다.</p>
<p>✔ <strong><code>echo "jobid: $SLURM_JOB_ID"</code></strong> jobid가 표기됩니다.</p>
<p>✔ <strong><code>module ~</code></strong> 원하는 Linux 환경을 구축할 수 있습니다. GPU 환경을 사용하고 싶은 경우에만 해당하며, GPU 환경을 사용하지 않을 경우(CPU Partition 사용) 지우셔도 무관합니다. Chapter3. 환경 구축에서 설명한 module envrionment에 해당합니다. 자세한 설명은 해당 파트에서 확인하세요.</p>
<p>✔ <strong><code>python -m jupyter lab $HOME \ --ip=0.0.0.0 \ --no-browse</code></strong> Jupyter notebook을 실행하는 코드입니다.</p>
</section>
<section id="배치-파일-실행-1" class="level3 unnumbered">
<h3 class="unnumbered anchored" data-anchor-id="배치-파일-실행-1">2.2 배치 파일 실행</h3>
<p>배치 파일을 실행하기에 앞서, 본인이 생성했던 Python 가상 환경에 들어와 있는 상태인지 재 확인합니다.</p>
<p>이후, terminal에 <code>sbatch</code> 명령어를 이용하여 지정한 배치 파일명을 입력 및 실행하세요. 이는 작업(job)을 제출한다는 의미입니다.</p>
<p>실행 후 나온 결과 값은 작업(job)에 대한 ID이니 꼭 따로 저장하거나 메모해두시기를 요청드립니다.</p>
<div class="cell">
<div class="sourceCode cell-code" id="cb4"><pre class="sourceCode bash code-with-copy"><code class="sourceCode bash"><span id="cb4-1"><a href="#cb4-1" aria-hidden="true" tabindex="-1"></a><span class="ex">sbatch</span> filename.sh <span class="co"># ex) sbatch jupyter.sh </span></span></code><button title="Copy to Clipboard" class="code-copy-button"><i class="bi"></i></button></pre></div>
</div>
<p>작업(job) 제출이 정상적으로 진행되었다면, STDOUT폴더 안에 OUT 파일이 생성됩니다.</p>
<p>만일 OUT파일이 생성되지 않았다면, 해당 Partition의 노드에 기존 작업(job)이 모두 할당되어 수행하지 못했을 가능성이 높습니다. 이 경우 terminal에 <code>squeue</code> 명령어를 입력하시고, 본인의 ID를 찾습니다.</p>
<p>보통 배정이 되어있다면 정상적으로 n001, n002 … 으로 노드에 배정되어 있지만, 배정되지 않았을 경우 ( <em>Resources, Priority</em> )라는 메시지를 볼 수 있습니다. 그런 경우 다른 노드가 일이 끝나는 것을 기다리거나, 해당 파티션이 아닌 다른 파티션을 이용하여 노드를 배정받아야 합니다.</p>
<p>다른 파티션을 이용하기 위해서는 Partition 목록에서 Partition과 cpus-per-task, gpu 갯수를 Partition에 맞게 수정하여 작업(job)을 다시 제출하셔야 합니다.</p>
<p>이제 생성된 ERR파일을 확인하고, Jupyter Notebook을 웹으로 실행시켜보겠습니다.</p>
</section>
<section id="포트-포워딩" class="level3 unnumbered">
<h3 class="unnumbered anchored" data-anchor-id="포트-포워딩">2.3 포트 포워딩</h3>
<ol type="1">
<li><p>STDERR폴더에 생성되어있는 ERR 파일을 확인합니다. <img src="./jpg/port_step1.jpg" class="img-fluid"></p></li>
<li><p>빨간색 박스 안의 부분을 복사하세요. <img src="./jpg/port_step2.jpg" class="img-fluid"></p></li>
<li><p>VScode의 하단에 PORTS 탭을 클린한 후, Forward a Port를 클릭합니다. <img src="./jpg/port_step3.jpg" class="img-fluid"></p></li>
<li><p>2에서 복사한 코드는 Port에 붙여넣은 후, Open in Browser를 클릭합니다. <img src="./jpg/port_step4.jpg" class="img-fluid"></p></li>
<li><p>웹에서 Jupyter 환경에 접속됩니다.</p></li>
</ol>
</section>
<section id="jupyter-notebook-로그인" class="level3 unnumbered">
<h3 class="unnumbered anchored" data-anchor-id="jupyter-notebook-로그인">2.4 Jupyter Notebook 로그인</h3>
<p>가장 처음 Jupyter 환경에 로그인하게 된다면, 다음과 같은 화면을 볼 수 있습니다. Jupyter Notebook의 접속방식으로는 두 가지 방법이 있습니다. 토큰 접속과 패스워드 접속입니다.</p>
<p><strong>1. 토큰 접속</strong></p>
<p>STDERR폴더에 생성되어있는 ERR 파일에는 Token 값도 함께 포함되어있습니다. <img src="./jpg/token.jpg" class="img-fluid"></p>
<p>빨간색 박스 안의 부분이 Token에 해당합니다. 이 Token을 저장한 후, Password에 붙여 넣어 로그인합니다. <img src="./jpg/jupyter_1.jpg" class="img-fluid"></p>
<p>만일 1번의 방식을 사용했다면, 재접속 시에도 Token을 매번 입력해주어야합니다.</p>
<p><strong>2. 패스워드 접속</strong></p>
<p>Token을 저장한 후, Token에 붙여 넣고 New Password에 본인이 원하는 Password를 지정하여 입력합니다. <img src="./jpg/jupyter_2.jpg" class="img-fluid"></p>
<p>만일 2번의 방식을 사용했다면, 재접속 시에는 이 때 지정한 Password 입력 화면이 뜨게 됩니다.</p>
<p>위 과정들을 모두 진행했다면 정상적으로 Jupyter Notebook이 구동될 것입니다.</p>
</section>
<section id="jupyter-notebook-작업-마치기" class="level3 unnumbered">
<h3 class="unnumbered anchored" data-anchor-id="jupyter-notebook-작업-마치기">2.5 Jupyter Notebook 작업 마치기</h3>
<p>반드시 Jupyter Nobetook을 이용한 작업을 모두 끝낸 후에는 <strong>File → Shut Down</strong>을 눌러주거나, VScode의 terminal에서 <strong><code>scancel {job_ID}</code></strong> 명령어를 실행해주어야합니다. 이 때, job_ID는 앞서 배치에서 지정되었던 job_ID입니다.</p>
<p>이는 작업(job)을 마치고 노드를 비워준다는 의미입니다. 노드가 비워져야 다음 사람이 사용할 수 있으니 유의바랍니다.</p>
<p><img src="./jpg/shutdown.jpg" class="img-fluid"></p>
</section>
</section>
</main> <!-- /main -->
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// For code content inside modals, clipBoardJS needs to be initialized with a container option
// TODO: Check when it could be a function (https://github.com/zenorocha/clipboard.js/issues/860)
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}
var localhostRegex = new RegExp(/^(?:http|https):\/\/localhost\:?[0-9]*\//);
var mailtoRegex = new RegExp(/^mailto:/);
var filterRegex = new RegExp('/' + window.location.host + '/');
var isInternal = (href) => {
return filterRegex.test(href) || localhostRegex.test(href) || mailtoRegex.test(href);
}
// Inspect non-navigation links and adorn them if external
var links = window.document.querySelectorAll('a[href]:not(.nav-link):not(.navbar-brand):not(.toc-action):not(.sidebar-link):not(.sidebar-item-toggle):not(.pagination-link):not(.no-external):not([aria-hidden]):not(.dropdown-item):not(.quarto-navigation-tool):not(.about-link)');
for (var i=0; i<links.length; i++) {
const link = links[i];
if (!isInternal(link.href)) {
// undo the damage that might have been done by quarto-nav.js in the case of
// links that we want to consider external
if (link.dataset.originalHref !== undefined) {
link.href = link.dataset.originalHref;
}
}
}
function tippyHover(el, contentFn, onTriggerFn, onUntriggerFn) {
const config = {
allowHTML: true,
maxWidth: 500,
delay: 100,
arrow: false,
appendTo: function(el) {
return el.parentElement;
},
interactive: true,
interactiveBorder: 10,
theme: 'quarto',
placement: 'bottom-start',
};
if (contentFn) {
config.content = contentFn;
}
if (onTriggerFn) {
config.onTrigger = onTriggerFn;
}
if (onUntriggerFn) {
config.onUntrigger = onUntriggerFn;
}
window.tippy(el, config);
}
const noterefs = window.document.querySelectorAll('a[role="doc-noteref"]');
for (var i=0; i<noterefs.length; i++) {
const ref = noterefs[i];
tippyHover(ref, function() {
// use id or data attribute instead here
let href = ref.getAttribute('data-footnote-href') || ref.getAttribute('href');
try { href = new URL(href).hash; } catch {}
const id = href.replace(/^#\/?/, "");
const note = window.document.getElementById(id);
if (note) {
return note.innerHTML;
} else {
return "";
}
});
}
const xrefs = window.document.querySelectorAll('a.quarto-xref');
const processXRef = (id, note) => {
// Strip column container classes
const stripColumnClz = (el) => {
el.classList.remove("page-full", "page-columns");
if (el.children) {
for (const child of el.children) {
stripColumnClz(child);
}
}
}
stripColumnClz(note)
if (id === null || id.startsWith('sec-')) {
// Special case sections, only their first couple elements
const container = document.createElement("div");
if (note.children && note.children.length > 2) {
container.appendChild(note.children[0].cloneNode(true));
for (let i = 1; i < note.children.length; i++) {
const child = note.children[i];
if (child.tagName === "P" && child.innerText === "") {
continue;
} else {
container.appendChild(child.cloneNode(true));
break;
}
}
if (window.Quarto?.typesetMath) {
window.Quarto.typesetMath(container);
}
return container.innerHTML
} else {
if (window.Quarto?.typesetMath) {
window.Quarto.typesetMath(note);
}
return note.innerHTML;
}
} else {
// Remove any anchor links if they are present
const anchorLink = note.querySelector('a.anchorjs-link');
if (anchorLink) {
anchorLink.remove();
}
if (window.Quarto?.typesetMath) {
window.Quarto.typesetMath(note);
}
// TODO in 1.5, we should make sure this works without a callout special case
if (note.classList.contains("callout")) {
return note.outerHTML;
} else {
return note.innerHTML;
}
}
}
for (var i=0; i<xrefs.length; i++) {
const xref = xrefs[i];
tippyHover(xref, undefined, function(instance) {
instance.disable();
let url = xref.getAttribute('href');
let hash = undefined;
if (url.startsWith('#')) {
hash = url;
} else {
try { hash = new URL(url).hash; } catch {}
}
if (hash) {
const id = hash.replace(/^#\/?/, "");
const note = window.document.getElementById(id);
if (note !== null) {
try {
const html = processXRef(id, note.cloneNode(true));
instance.setContent(html);
} finally {
instance.enable();
instance.show();
}
} else {
// See if we can fetch this
fetch(url.split('#')[0])
.then(res => res.text())
.then(html => {
const parser = new DOMParser();
const htmlDoc = parser.parseFromString(html, "text/html");
const note = htmlDoc.getElementById(id);
if (note !== null) {
const html = processXRef(id, note);
instance.setContent(html);
}
}).finally(() => {
instance.enable();
instance.show();
});
}
} else {
// See if we can fetch a full url (with no hash to target)
// This is a special case and we should probably do some content thinning / targeting
fetch(url)
.then(res => res.text())
.then(html => {
const parser = new DOMParser();
const htmlDoc = parser.parseFromString(html, "text/html");
const note = htmlDoc.querySelector('main.content');
if (note !== null) {
// This should only happen for chapter cross references
// (since there is no id in the URL)
// remove the first header
if (note.children.length > 0 && note.children[0].tagName === "HEADER") {
note.children[0].remove();
}
const html = processXRef(null, note);
instance.setContent(html);
}
}).finally(() => {
instance.enable();
instance.show();
});
}
}, function(instance) {
});
}
let selectedAnnoteEl;
const selectorForAnnotation = ( cell, annotation) => {
let cellAttr = 'data-code-cell="' + cell + '"';
let lineAttr = 'data-code-annotation="' + annotation + '"';
const selector = 'span[' + cellAttr + '][' + lineAttr + ']';
return selector;
}
const selectCodeLines = (annoteEl) => {
const doc = window.document;
const targetCell = annoteEl.getAttribute("data-target-cell");
const targetAnnotation = annoteEl.getAttribute("data-target-annotation");
const annoteSpan = window.document.querySelector(selectorForAnnotation(targetCell, targetAnnotation));
const lines = annoteSpan.getAttribute("data-code-lines").split(",");
const lineIds = lines.map((line) => {
return targetCell + "-" + line;
})
let top = null;
let height = null;
let parent = null;
if (lineIds.length > 0) {
//compute the position of the single el (top and bottom and make a div)
const el = window.document.getElementById(lineIds[0]);
top = el.offsetTop;
height = el.offsetHeight;
parent = el.parentElement.parentElement;
if (lineIds.length > 1) {
const lastEl = window.document.getElementById(lineIds[lineIds.length - 1]);
const bottom = lastEl.offsetTop + lastEl.offsetHeight;
height = bottom - top;
}
if (top !== null && height !== null && parent !== null) {
// cook up a div (if necessary) and position it
let div = window.document.getElementById("code-annotation-line-highlight");
if (div === null) {
div = window.document.createElement("div");
div.setAttribute("id", "code-annotation-line-highlight");
div.style.position = 'absolute';
parent.appendChild(div);
}
div.style.top = top - 2 + "px";
div.style.height = height + 4 + "px";
div.style.left = 0;
let gutterDiv = window.document.getElementById("code-annotation-line-highlight-gutter");
if (gutterDiv === null) {
gutterDiv = window.document.createElement("div");
gutterDiv.setAttribute("id", "code-annotation-line-highlight-gutter");
gutterDiv.style.position = 'absolute';
const codeCell = window.document.getElementById(targetCell);
const gutter = codeCell.querySelector('.code-annotation-gutter');
gutter.appendChild(gutterDiv);
}
gutterDiv.style.top = top - 2 + "px";
gutterDiv.style.height = height + 4 + "px";
}
selectedAnnoteEl = annoteEl;
}
};
const unselectCodeLines = () => {
const elementsIds = ["code-annotation-line-highlight", "code-annotation-line-highlight-gutter"];
elementsIds.forEach((elId) => {
const div = window.document.getElementById(elId);
if (div) {
div.remove();
}
});
selectedAnnoteEl = undefined;
};
// Handle positioning of the toggle
window.addEventListener(
"resize",
throttle(() => {
elRect = undefined;
if (selectedAnnoteEl) {
selectCodeLines(selectedAnnoteEl);
}
}, 10)
);
function throttle(fn, ms) {
let throttle = false;
let timer;
return (...args) => {
if(!throttle) { // first call gets through
fn.apply(this, args);
throttle = true;
} else { // all the others get throttled
if(timer) clearTimeout(timer); // cancel #2
timer = setTimeout(() => {
fn.apply(this, args);
timer = throttle = false;
}, ms);
}
};
}
// Attach click handler to the DT
const annoteDls = window.document.querySelectorAll('dt[data-target-cell]');
for (const annoteDlNode of annoteDls) {
annoteDlNode.addEventListener('click', (event) => {
const clickedEl = event.target;
if (clickedEl !== selectedAnnoteEl) {
unselectCodeLines();
const activeEl = window.document.querySelector('dt[data-target-cell].code-annotation-active');
if (activeEl) {
activeEl.classList.remove('code-annotation-active');
}
selectCodeLines(clickedEl);
clickedEl.classList.add('code-annotation-active');
} else {
// Unselect the line
unselectCodeLines();
clickedEl.classList.remove('code-annotation-active');
}
});
}
const findCites = (el) => {
const parentEl = el.parentElement;
if (parentEl) {
const cites = parentEl.dataset.cites;
if (cites) {
return {
el,
cites: cites.split(' ')
};
} else {
return findCites(el.parentElement)
}
} else {
return undefined;
}
};
var bibliorefs = window.document.querySelectorAll('a[role="doc-biblioref"]');
for (var i=0; i<bibliorefs.length; i++) {
const ref = bibliorefs[i];
const citeInfo = findCites(ref);
if (citeInfo) {
tippyHover(citeInfo.el, function() {
var popup = window.document.createElement('div');
citeInfo.cites.forEach(function(cite) {
var citeDiv = window.document.createElement('div');
citeDiv.classList.add('hanging-indent');
citeDiv.classList.add('csl-entry');
var biblioDiv = window.document.getElementById('ref-' + cite);
if (biblioDiv) {
citeDiv.innerHTML = biblioDiv.innerHTML;
}
popup.appendChild(citeDiv);
});
return popup.innerHTML;
});
}
}
});
</script>
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