Добрый день.
Столкнулся с таким поведением - создал новый проект, запустил generamba setup, благополучно прошел этап настройки в котором указал The project prefix (пусть будет для примера SV). Создаю модуль MyModule (да, название не удачное, но с ходу лучше ничего не придумал для тестового проекта) и с удивление вижу что у файлов префикс имеется, а у сущностей внутри его нет т.е. например, есть файл SVMyModuleInteractorInput.swift внутри которого объявлен протокол MyModuleInteractorInput без префикса и так со всеми классами\протоколами, полез в сами шаблоны - префиксов там действительно нет. Это так и было задумано или все-таки ошибка?
Если ошибка - дайте знать, я для себя буду править отсутствие префиксов в шаблонах и просто залью его тогда пулреквестом
С уважением