main.tex

%% Template for diploma thesis | FBMI CTU
% Modified on the basis of the thesis requirements 2022
%
% Author:	Marek Sokol
% Contact:	sokolma5@fbmi.cvut.cz
%

% arara: lualatexmk: { shell : yes }
% arara: makeglossaries
% arara: biber
% arara: lualatexmk: { shell : yes }
% arara: lualatexmk: { shell : yes }

% % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % %
% Preamble
% % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % %

\documentclass[a4paper,12pt,czech,oneside]{memoir}
\setlrmarginsandblock{3.5cm}{2.5cm}{*}
\setulmarginsandblock{2.5cm}{2.5cm}{1}
\checkandfixthelayout

% Packages
\usepackage[main=czech,english]{babel}
\usepackage{microtype}
\usepackage{mathtools,amssymb}
\usepackage[no-math]{fontspec}
\usepackage{unicode-math}
\usepackage{float}
\usepackage{dirtree}
\usepackage{siunitx}
\usepackage{luavlna}
\usepackage[unicode,pdfusetitle,hidelinks]{hyperref}
\usepackage[dvipsnames]{xcolor}
\usepackage{subcaption}
\usepackage{graphicx}
\usepackage{pdfpages}
\usepackage[flushleft]{threeparttable}
\usepackage{tocloft}
\usepackage{booktabs}
\usepackage{multirow}
\usepackage[ruled,lined,linesnumbered,czech,onelanguage]{algorithm2e}
% \usepackage{array}
\usepackage{footnote}
% \usepackage[bottom]{footmisc}
\usepackage{url}
\usepackage{enumitem}
\usepackage{xurl}
\usepackage[xparse]{tcolorbox}
% \usepackage{etoolbox}
% \usepackage{showframe}

% Graphics and plots
\usepackage{tikz}
\usetikzlibrary{calc,matrix,positioning,shapes.geometric,shapes.multipart,decorations.pathreplacing,babel}

% Support for acronyms
\usepackage[nopostdot,symbols,acronym,nonumberlist,toc,automake,nolangwarn,section]{glossaries-extra}
\usepackage{glossary-longextra}
% \glsaddkey{unit}{\glsentrytext{\glslabel}}{\glsentryunit}{\GLsentryunit}{\glsunit}{\Glsunit}{\GLSunit}
% \glssetnoexpandfield{symbol}
\glstocfalse
\makeglossaries
\loadglsentries{glossary.tex}
\renewcommand*{\acronymname}{Seznam zkratek}
\renewcommand*{\glssymbolsgroupname}{Seznam symbolů}
% \renewcommand*{\entryname}{Notace}
% \renewcommand{\symbolname}{Jednotka}
\renewcommand*{\descriptionname}{Význam}

% Change entry name in the symbol list
\newglossarystyle{long-cz-symbols}{%
 \setglossarystyle{long-name-desc}% 
 	\renewcommand*{\glsgroupskip}{}
    \renewcommand{\entryname}{Symbol}
    \renewcommand{\symbolname}{Jednotka}
}

% Change entry name in the acronym list
\newglossarystyle{long-cz-acronyms}{%
 \setglossarystyle{long-name-desc}% 
    \renewcommand{\entryname}{Zkratka}
}

% Czech quotes 
\usepackage{csquotes}
\def\uv#1{„#1“}
\DeclareQuoteStyle{czech}
		{\quotedblbase}			% opening outer mark
		{\textquotedblleft}		% closing outer mark
		{\textquoteleft}		% opening inner mark
		{\textquoteright}		% closing inner mark
\setquotestyle{czech}

% Citations
\usepackage[backend=biber,style=iso-numeric,citestyle=numeric-comp,maxbibnames=5,minbibnames=5]{biblatex}
\addbibresource{library.bib}
\renewcommand*{\bibfont}{\footnotesize}

% Theorems
\newtheorem{theorem}{Teorém}[chapter]

% Change memoir appendices name
\renewcommand{\appendixpagename}{Přílohy}
\renewcommand{\appendixtocname}{Přílohy}

% Line breaks in URL
% \def \UrlBreaks {\do\/\do\-}

% Use per-chapter numbering
\setcounter{secnumdepth}{3}
\setcounter{tocdepth}{2}
\numberwithin{equation}{chapter}
\counterwithout*{footnote}{chapter}

% Change toc style
% \renewcommand{\cfttoctitlefont}{\Huge\bfseries\sffamily}
% \renewcommand{\cftaftertoctitle}{\hfill}
% \renewcommand{\cftchapdotsep}{\cftdotsep}
% \setlength{\cftbeforetoctitleskip}{20pt}
% \setlength{\cftaftertoctitleskip}{30pt}

% Use sans-serif and smaller font for captions
\usepackage{caption}
\captionsetup{
	font = {small, sf},
	labelfont = {bf},
	figurewithin = chapter,
  	tablewithin = chapter
}

% Adjust boxes size (math)
\setlength{\fboxsep}{8pt}

% Tune hyphenation
\pretolerance=1500
\tolerance=1000

% Try to minimalize widows and orphans
\clubpenalty 10000
\widowpenalty 10000

% Set assets extensions and path
\DeclareGraphicsExtensions{.pdf,.png,.jpg}
\graphicspath{{assets/}}

% Formatting according to requirements
\setlength{\parskip}{6pt}
\setlength{\parindent}{0.75cm}
\DisemulatePackage{setspace}
\usepackage{setspace}
\setstretch{1.20}
\newcolumntype{C}[1]{>{\centering\let\newline\\\arraybackslash\hspace{0pt}}m{#1}}
\makeoddfoot{ruled}{}{\thepage}{}
\makeevenfoot{ruled}{}{\thepage}{}

% % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % %
% General commands
% % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % %

% Remove indents before chapter headings (mainly for book class)
% \DeclareRobustCommand{\chapterstyletitle}[1]{
% 	\@makechapterhead{#1}
% 	\noindent
% }

% end of preambles

%% Names
\newcommand{\autor}{Bc. Marek Sokol}
\newcommand{\vedouci}{Mgr. Ksenia Sedova, Ph.D.}
\newcommand{\nazev}{Hodnocení kognitivní zátěže v extrémním prostředí}
\newcommand{\nazevENG}{Assessment of cognitive load in extreme environment}
\newcommand{\typ}{Diplomová práce}
\newcommand{\rok}{2023}
\newcommand{\program}{Biomedicínské inženýrství}
\newcommand{\fakulta}{FAKULTA BIOMEDICÍNSKÉHO INŽENÝRSTVÍ}
\newcommand{\cvut}{ČESKÉ VYSOKÉ UČENÍ TECHNICKÉ V~PRAZE}
\newcommand{\katedra}{Katedra biomedicínské techniky}
\newcommand{\ra}[1]{\renewcommand{\arraystretch}{#1}}

\begin{document}
\pagestyle{empty}
% % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % %
% Title page
% % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % %
\begin{titlingpage}
	\begin{center}
		\begin{figure}[!h]
			\centering
			\includegraphics[width=0.2\textwidth]{symbol_cvut_konturova_verze}
		\end{figure}
		\textsf{\large{\textbf{\cvut}}}
		{\color{NavyBlue}\makebox[\linewidth]{\rule[.2\baselineskip]{\textwidth}{0.4mm}}}
		\textsf{\normalsize{\textbf{\fakulta}}}\\

		\textsf{\textbf{\katedra}}

		\vfill

		\textsf{\Large{\textbf{\nazev}}}

		\vspace{36pt}

		\textsf{\Large{\textbf{\nazevENG}}}

		\vspace{48pt}

		\textsf{\typ}

		\vfill

	\end{center}
	\textsf{Studijní program: \program}

	\vspace{12pt}

	\noindent\textsf{Vedoucí práce: \vedouci}

	\vspace{24pt}

	\begin{center}
		\textsf{\textbf{\autor}} \\ [0.5cm]
		{\color{NavyBlue}\makebox[\linewidth]{\rule{\textwidth}{0.4mm}}}
		\textsf{\textbf{Kladno \rok}}
	\end{center}
\end{titlingpage}

% Insert pdf assignment
\includepdf{assets/assignment.pdf}

% Declaration
\null\vfill
\section*{Prohlášení}
Prohlašuji, že jsem diplomovou práci s názvem \uv{\nazev} vypracoval/a
samostatně a~použil/a k~tomu úplný výčet citací použitých pramenů, které uvádím
v seznamu přiloženém k~diplomové práci.

\hspace{-0.75cm}Nemám závažný důvod proti užití tohoto školního díla ve smyslu
\S 60 Zákona č.121/2000~Sb., o~právu autorském, o~právech souvisejících s právem
autorským a~o~změně některých zákonů (autorský zákon), ve znění pozdějších
předpisů.
\vspace{1em}

\hspace{-0.75cm} V Kladně dne~\makebox[\widthof{V Kladně dne~}]{.\dotfill}
\hfill
\begin{tabular}[t]{@{}c@{}}
	\makebox[12em]{\dotfill} \\
	\textbf{\autor}
\end{tabular}
\clearpage


% Copyright
\null\vfill

\noindent České vysoké učení technické v~Praze

\noindent Fakulta biomedicínského inženýrství

\noindent \textcopyright{} \rok~\autor. Všechna práva vyhrazena.

\noindent \textit{Tato práce vznikla jako školní dílo na Českém vysokém učení
	technickém v~Praze, Fakultě biomedicínského inženýrství. Práce je chráněna
	právními předpisy a mezinárodními úmluvami o právu autorském a právech
	souvisejících s právem autorským. K jejímu užití, s výjimkou bezúplatných
	zákonných licencí a nad rámec oprávnění uvedených v Prohlášení na předchozí
	straně, je nezbytný souhlas autora.}

\subsection*{Odkaz na tuto práci} Sokol, Marek. \textit{\nazev}. \typ. Praha:
České vysoké učení technické v Praze, Fakulta biomedicínského inženýrství, 2023.
Dostupné z:
$\langle$\url{https://github.com/sokolmarek/masters-thesis}$\rangle$.
\clearpage

% Acknowledgements
\null\vfill
\section*{Poděkování}
\input{chapters/podekovani.tex}
\clearpage

% Abstracts
\null\vfill
\section*{Abstrakt}
\subsection*{\nazev:}
\input{chapters/abstract/abstract_cs.tex}
\subsection*{Klíčová slova}
kognitivní zátěž, fyziologický signál, elektrokardiogram, dechová aktivita,
elektrodermální aktivita, strojové učení, neuronové sítě, vesmír, analogové mise
\clearpage

\null\vfill
\section*{Abstract}
\subsection*{\nazevENG:}
\input{chapters/abstract/abstract_en.tex}
\subsection*{Key words}
cognitive load, physiological signal, electrocardiogram, respiratory activity,
electrodermal activity, machine learning, neural networks, space, analog missions
\clearpage

% Numberings starts from here
\pagestyle{plain}

% Insert content
\chapterstyle{default}
\setlength\beforechapskip{-\baselineskip}
\setlength\afterchapskip{10pt}
\renewcommand{\contentsname}{\sffamily Obsah}
\tableofcontents*

\glsaddall
\clearpage

% Glossaries
\chapter*{\sffamily Seznam symbolů a zkratek}
\addcontentsline{toc}{chapter}{Seznam symbolů a zkratek}
\printsymbols[style=long-cz-symbols]
\printacronyms[style=long-cz-acronyms]
\clearpage

% % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % %
% Content
% % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % %
\chapterstyle{madsen}
\pagestyle{ruled}
% \setlength\beforechapskip{-\baselineskip}

\chapter{Úvod}
\input{chapters/01_uvod}
\clearpage

\chapter{Přehled současného stavu}
\input{chapters/02_prehled_soucasneho_stavu}
\clearpage

\chapter{Cíle práce}
\input{chapters/03_cile_prace}
\clearpage

\chapter{Metody}
\input{chapters/04_metody}
\clearpage

\chapter{Výsledky}
\input{chapters/05_vysledky}
\clearpage

\chapter{Diskuse}
\input{chapters/06_diskuse}
\clearpage

\chapter{Závěr}
\input{chapters/07_zaver}
\clearpage

% % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % %
% Citations
% % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % %
\chapterstyle{madsen}
\setlength\beforechapskip{-\baselineskip}
\renewcommand{\bibname}{Seznam použité literatury}
% \addcontentsline{toc}{chapter}{Seznam použité literatury}
\printbibliography
\clearpage

% % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % %
% Appendices
% % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % % %

\begin{appendices}
	\appendixpage
	\input{chapters/prilohy}
\end{appendices}

\end{document}