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Mass++/Mass++4: オープンソース・MSデータビューア

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Mass++/Mass++4について

私たちは高速スペクトルビューア「Mass++」を開発し、これは全バージョン合計で今までおよそ2万回ダウンロードされてきました。現在開発中のバージョンはVer.4で、オープンソースソフトウェアとして、新たにJava言語で書き直し、複数のOSに対応できるようにしました。今回、これまで開発してきた様々な機能を整理し、Ver.4の正式リリース（Ver.4 Gold）として、基本的な機能、特にスペクトルやクロマトグラムの表示に関する機能（スペクトル／クロマトグラムのズーム、ピークのラベル付け、スペクトル／クロマトグラムの画像ファイルへのエクスポート、_m/z_値や保持時間値によるスペクトルの絞り込み機能など）を中心にパッケージを作成しました。このVer.4 Goldパッケージは4つのOS環境(Windows、MacOS、Linux Debian/Ubuntu、Linux RPM)でリリースされます。

なお、今後のバージョン管理およびVer.2.7系列との区別のために、「Mass++ Ver.4 Gold」は公開にあたって「Mass++4 Ver.1.0.0」と改称されました。今後はこちらの名称を主に使用していきます。

実行形式パッケージ（インストーラー）・ダウンロード

現行（最新）バージョン

Ver.4（Mass++4）系列（最新ビルド） ダウンロードページ （Windows, macOS, Linux RPM, Linux Debian/Ubuntu版）

  • Mass++4 ver.1.0.0 （旧名 Mass++ ver.4 Gold（正式版））
    • Mass++4は「Mass++ ver.4」として開発が進められてきたバージョンで、ver.2.7.4のユーザーがまだ多く混乱を避けるのが望ましいこと、機能的に大きく違いがあることなどから、ソフト名ごと改称したものです。「Mass++4 ver. 1.0.0」は、開発時に「Mass++ ver.4 Gold（正式版）」と呼んでいたバージョンと同一です。現在はこのバージョンのみ開発が行われています。

過去のバージョン

Ver.4（Mass++4）系列（ver.0.2.1以前） ダウンロードページ （Windows, macOS, Linux RPM, Linux Debian/Ubuntu版）

  • Mass++4 ver.0.2.1 （旧名 Mass++ ver.4 beta2）
  • Mass++4 ver.0.2.0 （旧名 Mass++ ver.4 beta）
  • Mass++4 ver.0.1.0 （旧名 Mass++ ver.4 alpha）

Ver.2系列 ダウンロードページ （Windows版のみ）

  • ver.2.7.4とver.2.7.5は共に開発環境が古いため、一切のバグ修正・サポートができません。ご使用は自己責任でお願いします。
  • Mass++ ver.2.7.5
    • Mass++はver.2.7.4まではソースコードを公開せずに実行ファイルのみを公開してきました。ver.2.7.5は、ver.2.7.4から一部の機能を削除してオープンソース版に変更したものです。
  • Mass++ ver.2.7.4
    • Mass++ver.2系列の本来の最終版であるver.2.7.4は解析機能などを多数含むもので、現在でも多くのユーザーがおられます。このファイルは、2025年3月31日まで（株）島津製作所・田中耕一記念質量分析研究所のwebサイトで配布していたものと同一です。島津製作所は本サイトでの配布には一切関わっておらず、本バージョンのサポートも一切行いません。

ソースコード・リポジトリ

リリースノート

  • 2026/02/23: Mass++4 ver.1.0.0 (Mass++ ver.4.0 Gold) リリース
    • Updated whole system to apply new concept
    • 基本機能の書き直しと再実装
  • 2021/12/04: Mass++4 ver.0.2.1 (Mass++ ver.4.0 beta2) リリース
    • バグ修正 ベータ版に対する修正
      • MS/MSスペクトルのプリカーサーイオン質量が、Raw data タブのSpectrumViewTableに表示されるようにした。
      • Projectタブを開いているときに、MS/MSスペクトルに対するペプチド同定処理が実行できるようにした。
      • macOS/Linux版で、Projectタブを開いて行うペプチド同定処理の過程で、ピークリストが生成されるようにした。
  • 2020/06/08: Mass++4 ver.0.2.0 (Mass++ ver.4.0 beta) リリース
    • アルファ版から 機能を追加
      • 外部アプリケーション実行・データ交換
      • データ・アノテーション表示
      • ピークピッキング
        • ProteoWizard ver. 3.0.20123の利用 (Windows環境のみ)
      • ペプチドアノテーション（同定）用サーチエンジンのサポート
        • Comet ver. 2019.01 rev. 5 (Windows環境のみ)
      • 対応ファイル
        • mzML, MGF, pepXML (manual)
      • 対応OS
        • Windows, macOS, Linux Debian/Ubuntu, Linux RPM
  • 2019/09/17: Mass++4 ver.0.1.0 (Mass++ ver.4.0 alpha) リリース
    • 複数OS対応の新バージョンリリース開始
    • 実装した基本機能
      • スペクトル・クロマトグラム表示
        • TIC, XIC, MS1, MS/MS
        • ミラープロット
        • オーバーラップ
      • ヒートマップ
        • 2D, 3D
      • データ・アノテーション表示 (manual)
      • 対応ファイル
        • mzML, MGF, pepXML (manual)
      • 対応OS
        • Windows, macOS

開発者について

Mass++ユーザー会のweb (https://mspp.ninja/) を参照してください。

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