-
Notifications
You must be signed in to change notification settings - Fork 0
/
Copy pathGio.cpp
1823 lines (1557 loc) · 57.6 KB
/
Gio.cpp
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
67
68
69
70
71
72
73
74
75
76
77
78
79
80
81
82
83
84
85
86
87
88
89
90
91
92
93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
103
104
105
106
107
108
109
110
111
112
113
114
115
116
117
118
119
120
121
122
123
124
125
126
127
128
129
130
131
132
133
134
135
136
137
138
139
140
141
142
143
144
145
146
147
148
149
150
151
152
153
154
155
156
157
158
159
160
161
162
163
164
165
166
167
168
169
170
171
172
173
174
175
176
177
178
179
180
181
182
183
184
185
186
187
188
189
190
191
192
193
194
195
196
197
198
199
200
201
202
203
204
205
206
207
208
209
210
211
212
213
214
215
216
217
218
219
220
221
222
223
224
225
226
227
228
229
230
231
232
233
234
235
236
237
238
239
240
241
242
243
244
245
246
247
248
249
250
251
252
253
254
255
256
257
258
259
260
261
262
263
264
265
266
267
268
269
270
271
272
273
274
275
276
277
278
279
280
281
282
283
284
285
286
287
288
289
290
291
292
293
294
295
296
297
298
299
300
301
302
303
304
305
306
307
308
309
310
311
312
313
314
315
316
317
318
319
320
321
322
323
324
325
326
327
328
329
330
331
332
333
334
335
336
337
338
339
340
341
342
343
344
345
346
347
348
349
350
351
352
353
354
355
356
357
358
359
360
361
362
363
364
365
366
367
368
369
370
371
372
373
374
375
376
377
378
379
380
381
382
383
384
385
386
387
388
389
390
391
392
393
394
395
396
397
398
399
400
401
402
403
404
405
406
407
408
409
410
411
412
413
414
415
416
417
418
419
420
421
422
423
424
425
426
427
428
429
430
431
432
433
434
435
436
437
438
439
440
441
442
443
444
445
446
447
448
449
450
451
452
453
454
455
456
457
458
459
460
461
462
463
464
465
466
467
468
469
470
471
472
473
474
475
476
477
478
479
480
481
482
483
484
485
486
487
488
489
490
491
492
493
494
495
496
497
498
499
500
501
502
503
504
505
506
507
508
509
510
511
512
513
514
515
516
517
518
519
520
521
522
523
524
525
526
527
528
529
530
531
532
533
534
535
536
537
538
539
540
541
542
543
544
545
546
547
548
549
550
551
552
553
554
555
556
557
558
559
560
561
562
563
564
565
566
567
568
569
570
571
572
573
574
575
576
577
578
579
580
581
582
583
584
585
586
587
588
589
590
591
592
593
594
595
596
597
598
599
600
601
602
603
604
605
606
607
608
609
610
611
612
613
614
615
616
617
618
619
620
621
622
623
624
625
626
627
628
629
630
631
632
633
634
635
636
637
638
639
640
641
642
643
644
645
646
647
648
649
650
651
652
653
654
655
656
657
658
659
660
661
662
663
664
665
666
667
668
669
670
671
672
673
674
675
676
677
678
679
680
681
682
683
684
685
686
687
688
689
690
691
692
693
694
695
696
697
698
699
700
701
702
703
704
705
706
707
708
709
710
711
712
713
714
715
716
717
718
719
720
721
722
723
724
725
726
727
728
729
730
731
732
733
734
735
736
737
738
739
740
741
742
743
744
745
746
747
748
749
750
751
752
753
754
755
756
757
758
759
760
761
762
763
764
765
766
767
768
769
770
771
772
773
774
775
776
777
778
779
780
781
782
783
784
785
786
787
788
789
790
791
792
793
794
795
796
797
798
799
800
801
802
803
804
805
806
807
808
809
810
811
812
813
814
815
816
817
818
819
820
821
822
823
824
825
826
827
828
829
830
831
832
833
834
835
836
837
838
839
840
841
842
843
844
845
846
847
848
849
850
851
852
853
854
855
856
857
858
859
860
861
862
863
864
865
866
867
868
869
870
871
872
873
874
875
876
877
878
879
880
881
882
883
884
885
886
887
888
889
890
891
892
893
894
895
896
897
898
899
900
901
902
903
904
905
906
907
908
909
910
911
912
913
914
915
916
917
918
919
920
921
922
923
924
925
926
927
928
929
930
931
932
933
934
935
936
937
938
939
940
941
942
943
944
945
946
947
948
949
950
951
952
953
954
955
956
957
958
959
960
961
962
963
964
965
966
967
968
969
970
971
972
973
974
975
976
977
978
979
980
981
982
983
984
985
986
987
988
989
990
991
992
993
994
995
996
997
998
999
1000
/**
@brief グラフィック用（含CT画像）ファイル入出力関数
@file Gio.cpp
@author Fumi.Iseki (C)
*/
#include "tools++.h"
#include "Gio.h"
#include "JpegTool.h"
using namespace jbxl;
///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
// ファイル識別子と共通ヘッダによるI/Oサポート
/**
CmnHead jbxl::readRasData(FILE* fp)
SUN RASTER形式のグラフィックファイルを読み込む．
@param fp 読み込むを行うファイルのファイル識別子．
@return 読み込んだグラフィックデータの共通ヘッダ．エラー場合 kindメンバは HEADER_NONEとなる．
@retval JBXL_GRAPH_MEMORY_ERROR @b xsize メモリエラー．
@bug 24ビット以上のエンディアン処理は未実装
*/
CmnHead jbxl::readRasData(FILE* fp)
{
RasHead rhd;
CmnHead hd;
int i, linebyte, databyte;
uByte null[2], *buf;
sWord* wptr;
hd.kind = RAS_DATA;
hd.bsize = 32;
hd.buf = NULL;
hd.grptr = NULL;
fseek(fp, 0, 0);
size_t ret = fread(&rhd, hd.bsize, 1, fp);
ntoh_st(&rhd, 4);
if (ret==0) {
hd.xsize = JBXL_FILE_READ_ERROR;
hd.kind = HEADER_NONE;
return hd;
}
hd.xsize = rhd.ras_width;
hd.ysize = rhd.ras_height;
hd.zsize = 1;
hd.depth = rhd.ras_depth;
hd.lsize = hd.xsize*hd.ysize*((hd.depth+7)/8);
hd.buf = (uByte*)malloc(hd.bsize);
if (hd.buf==NULL) {
hd.xsize = JBXL_GRAPH_MEMORY_ERROR;
hd.kind = HEADER_NONE;
return hd;
}
memcpy(hd.buf, (uByte*)&rhd, hd.bsize);
hd.grptr = (uByte*)malloc(hd.lsize);
if (hd.grptr==NULL) {
freeNull(hd.buf);
hd.xsize = JBXL_GRAPH_MEMORY_ERROR;
hd.kind = HEADER_NONE;
return hd;
}
memset(hd.grptr, 0, hd.lsize);
buf = (uByte*)hd.grptr;
fseek(fp, rhd.ras_maplength, 1);
databyte = hd.xsize*((hd.depth+7)/8);
linebyte = rhd.ras_length/hd.ysize;
if (databyte==linebyte) {
ret = fread(buf, hd.lsize, 1, fp);
if (ret==0) {
hd.xsize = JBXL_FILE_READ_ERROR;
hd.kind = HEADER_NONE;
return hd;
}
}
else {
for (i=0; i<hd.ysize; i++) {
ret = fread(buf, databyte, 1, fp);
if (ret>0) ret = fread(null, linebyte - databyte, 1, fp);
if (ret==0) {
hd.xsize = JBXL_FILE_READ_ERROR;
hd.kind = HEADER_NONE;
return hd;
}
buf += databyte;
}
}
if (hd.depth==16){
wptr = (sWord*)hd.grptr;
for(i=0; i<hd.xsize*hd.ysize; i++) wptr[i] = ntohs(wptr[i]);
}
return hd;
}
/**
int jbxl::writeRasData(FILE* fp, CmnHead* hd, int obit)
色々な画像データをSUN RASTER型式でファイルに保存する．
@param fp 保存するファイルポインタ．
@param hd 保存するデータを既述した共通ヘッダ．
@param obit SUN RASTERの 1ピクセルのビット数(8, 24をサポート)．
@retval >0 書き込んだバイト数．
@retval JBXL_GRAPH_MEMORY_ERROR メモリエラー．
*/
int jbxl::writeRasData(FILE* fp, CmnHead* hd, int obit)
{
RasHead shd;
int i, j, k, l, linebyte, databyte, depth, lsize;
uByte null=0x00, *ptr, *buf;
obit = Xabs(obit);
if (hd->kind == RAS_DATA) {
unsigned int u;
memcpy((sByte*)&shd, hd->buf, hd->bsize);
ptr = (uByte*)malloc(hd->lsize);
if (ptr==NULL) return JBXL_GRAPH_MEMORY_ERROR;
for (u=0; u<hd->lsize; u++) ptr[u] = hd->grptr[u];
lsize = hd->lsize;
}
else { // CT -> RAS
if (hd->depth==16) {
if (obit==8) depth = 8;
else depth = 24;
lsize = hd->xsize*hd->ysize*depth/8;
buf = (uByte*)malloc(lsize);
if (buf==NULL) return JBXL_GRAPH_MEMORY_ERROR;
memset(buf, 0, lsize);
if (obit==8) {
int max = 255; // 8bit mode での最大値
uWord* wp = (uWord*)hd->grptr;
for (i=0; i<hd->xsize*hd->ysize; i++) {
max = Max(max, wp[i]);
}
for (i=0; i<hd->ysize*hd->xsize; i++) {
buf[i] = 255*wp[i]/max;
}
}
else {
k = l = 0;
for (i=0; i<hd->ysize*hd->xsize; i++) {
buf[k++] = hd->grptr[l++];
buf[k++] = hd->grptr[l++];
buf[k++] = null;
}
}
}
else {
depth = hd->depth;
lsize = hd->lsize;
buf = (uByte*)hd->grptr;
}
databyte = hd->xsize*depth/8;
linebyte = lsize/hd->ysize;
if (linebyte%2==1) {
linebyte++;
lsize = linebyte*hd->ysize;
}
shd.ras_magic = RAS_MAGIC;
shd.ras_width = hd->xsize;
shd.ras_height = hd->ysize;
shd.ras_depth = depth;
shd.ras_length = lsize;
shd.ras_type = RT_STANDARD;
shd.ras_maptype = RMT_NONE;
shd.ras_maplength= 0;
ptr = (uByte*)malloc(lsize);
if (ptr==NULL) {
if (hd->depth==16) free(buf);
return -2;
}
memset(ptr, 0, lsize);
k = l = 0;
for (i=0 ; i<hd->ysize; i++) {
for (j=0; j<databyte; j++) ptr[k++] = buf[l++];
for (j=0; j<linebyte-databyte; j++) ptr[k++] = null;
}
if (hd->depth==16) free(buf);
}
hton_st(&shd, 4);
fwrite(&shd, sizeof(RasHead), 1, fp);
fwrite(ptr, lsize, 1, fp);
free(ptr);
return sizeof(RasHead)+lsize;
}
/**
CmnHead jbxl::readUserSetData(FILE* fp, CmnHead* chd, bool cnt=false);
オペレータ指定のヘッダ形式にしたがってグラフィックファイルを読み込む．
ヘッダ形式のチェック（ファイルサイズの整合性など）は行わないので，それらは呼び出し側の責任となる．@n
リトルエンディアン対応．カウンタ制御の場合は遅くなる．
@param fp 読み込むを行うファイルのファイル識別子．
@param[in] chd 読み込むファイルのヘッダ情報を入れた CmnHead.@n
カウンタを使用する場合： kind, xsize, ysize, zsize, bsize 必須．@n
カウンタを使用しない場合：kind, bsize, lseize 必須．
@param cnt 読み込み状況カウンタを使用するかどうか．@b true: 使用する．
@return 読み込んだグラフィックデータの共通ヘッダ．@n
エラー場合 kindメンバは HEADER_NONEとなる．またエラーの種類により xsizeが変化する．
@retval JBXL_GRAPH_HEADER_ERROR @b xsize オペレータ指定のヘッダがない．
@retval JBXL_GRAPH_MEMORY_ERROR @b xsize メモリエラー．
@retval JBXL_GRAPH_CANCEL @b xsize キャンセル．
@bug 24ビット以上のエンディアン処理は未実装
*/
CmnHead jbxl::readUserSetData(FILE* fp, CmnHead* chd, bool cnt)
{
CmnHead hd;
init_CmnHead(&hd);
CVCounter* counter = NULL;
if (chd==NULL) {
hd.xsize = JBXL_GRAPH_MEMORY_ERROR;
return hd;
}
else if ((chd->kind&0x0ff)!=USERSET_DATA) {
hd.xsize = JBXL_GRAPH_MEMORY_ERROR;
return hd;
}
hd = *chd;
// ヘッダ読み込み
fseek(fp, 0, 0);
hd.buf = (uByte*)malloc(hd.bsize);
if (hd.buf==NULL) {
hd.xsize = JBXL_GRAPH_MEMORY_ERROR;
hd.kind = HEADER_NONE;
return hd;
}
memset(hd.buf, 0, hd.bsize);
size_t ret = fread((void*)hd.buf, hd.bsize, 1, fp);
if (ret==0) {
hd.xsize = JBXL_FILE_READ_ERROR;
hd.kind = HEADER_NONE;
return hd;
}
// カウンタ
if (hd.zsize>=10 && cnt) {
counter = GetUsableGlobalCounter();
if (counter!=NULL) {
//counter->SetTitle("ユーザ指定ファイル読み込み中");
counter->SetMax((hd.zsize+1)/10);
counter->SetPos(1);
}
}
hd.grptr = (uByte*)malloc(hd.lsize);
if (hd.grptr==NULL) {
freeNull(hd.buf);
hd.xsize = JBXL_GRAPH_MEMORY_ERROR;
hd.kind = HEADER_NONE;
return hd;
}
memset(hd.grptr, 0, hd.lsize);
fseek(fp, hd.bsize, 0);
if (counter==NULL) {
ret = fread(hd.grptr, hd.lsize, 1, fp);
if (ret==0) {
hd.xsize = JBXL_FILE_READ_ERROR;
hd.kind = HEADER_NONE;
return hd;
}
}
else {
int psize = hd.xsize*hd.ysize*((hd.depth+7)/8);
for (int i=0; i<hd.zsize; i++) {
ret = fread(hd.grptr+i*psize, psize, 1, fp);
if (ret==0) {
hd.xsize = JBXL_FILE_READ_ERROR;
hd.kind = HEADER_NONE;
return hd;
}
if (i%10==0) {
counter->StepIt();
if (counter->isCanceled()) { // キャンセル
free_CmnHead(&hd);
hd.xsize = JBXL_GRAPH_CANCEL;
hd.kind = HEADER_NONE;
return hd;
}
}
}
}
if (hd.depth==16) {
if (checkBit(chd->kind, HAS_LENDIAN) && is_little_endian()) {
// CPU とファイルが同じ Little Endianなので，何もしない．
}
else {
sWord* wptr = (sWord*)hd.grptr;
for (int i=0; i<hd.xsize*hd.ysize*hd.zsize; i++) wptr[i] = ntohs(wptr[i]);
}
}
if (counter!=NULL) counter->PutFill();
return hd;
}
///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
// CTファイルサポート
//
/**
CmnHead jbxl::readMoonFile(const char* fn, bool no_ntoh)
MOON_DATA形式（16bit）のグラフィックファイルを読み込む．
@param fn 読み込むを行うファイル名．
@param no_ntoh trueの場合，エンディアンの変換を行わない．
@return 読み込んだグラフィックデータの共通ヘッダ．@n
エラー場合 kindメンバは HEADER_NONEとなる．またエラーの種類により xsizeが変化する．
@retval JBXL_GRAPH_MEMORY_ERROR @b xsize メモリエラー．
*/
CmnHead jbxl::readMoonFile(const char* fn, bool no_ntoh)
{
CmnHead hd;
FILE* fp;
unsigned int fsz;
memset(&hd, 0, sizeof(CmnHead));
hd.kind = HEADER_NONE;
fsz = file_size(fn);
if (fsz==0) {
hd.xsize = JBXL_GRAPH_NOFILE_ERROR;
return hd;
}
if ((fp=fopen(fn,"rb"))==NULL) {
hd.xsize = JBXL_GRAPH_OPFILE_ERROR;
return hd;
}
hd = readMoonData(fp, fsz, no_ntoh);
fclose(fp);
return hd;
}
/**
CmnHead jbxl::readMoonData(FILE* fp, unsigned int fsz, bool no_ntoh)
MOON_DATA形式（16bit）のグラフィックファイルを読み込む．
@param fp 読み込むを行うファイルのファイル識別子．
@param fsz ファイルのサイズ（チェックに使用, 0以下ならチェックしない）
@param no_ntoh @b trueの場合，エンディアンの変換を行わない．
@return 読み込んだグラフィックデータの共通ヘッダ． @n
エラー場合 kindメンバは HEADER_NONEとなる．またエラーの種類により xsizeが変化する．
@retval -2 @b xsize メモリエラー．
*/
CmnHead jbxl::readMoonData(FILE* fp, unsigned int fsz, bool no_ntoh)
{
int i;
size_t ret;
CTHead chd;
CmnHead hd;
hd.kind = HEADER_NONE;
hd.bsize = 64; // Moon形式のヘッダサイズ
// ヘッダ読み込み
fseek(fp, 0, 0);
ret = fread((void*)&chd, hd.bsize, 1, fp);
ntoh_st(&chd, 2);
if (ret==0) {
hd.xsize = JBXL_FILE_READ_ERROR;
hd.kind = HEADER_NONE;
return hd;
}
hd.xsize = chd.xsize - chd.cutleft - chd.cutright;
hd.ysize = chd.ysize - chd.cutup - chd.cutdown;
hd.zsize = 1;
hd.depth = 16;
hd.lsize = hd.xsize*hd.ysize*(hd.depth/8);
hd.buf = NULL;
hd.grptr = NULL;
if (fsz>0 && fsz!=hd.bsize+hd.lsize) return hd;
hd.buf = (uByte*)malloc(hd.bsize);
if (hd.buf==NULL) {
hd.xsize = JBXL_GRAPH_MEMORY_ERROR;
return hd;
}
memcpy(hd.buf, &chd, hd.bsize);
hd.kind = MOON_DATA;
hd.grptr = (uByte*)malloc(hd.lsize);
if (hd.grptr==NULL) {
freeNull(hd.buf);
hd.xsize = JBXL_GRAPH_MEMORY_ERROR;
hd.kind = HEADER_NONE;
return hd;
}
memset(hd.grptr, 0, hd.lsize);
fseek(fp, hd.bsize, 0);
ret = fread(hd.grptr, hd.lsize, 1, fp);
if (ret==0) {
hd.xsize = JBXL_FILE_READ_ERROR;
hd.kind = HEADER_NONE;
return hd;
}
if (!no_ntoh) {
sWord* wptr = (sWord*)hd.grptr;
for (i=0; i<hd.xsize*hd.ysize; i++) wptr[i] = ntohs(wptr[i]);
}
return hd;
}
///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
// DICOM
/**
int jbxl::dicomHeader(FILE* fp, int fsize, int* dsize, int* xsize, int* ysize, int* depth, double* rzxy)
DICOM型式のファイルからヘッダを読みだす．
@param fp DICOM型式ファイルへのファイル識別子
@param fsize ファイルのサイズ．
@param[out] dsize グラフィックデータの大きさが格納される．
@param[out] xsize グラフィックデータの Xサイズが格納される．
@param[out] ysize グラフィックデータの Yサイズが格納される．
@param[out] depth グラフィックデータのデプス(Bit)が格納される．
@param[out] rzxy Z軸の歪．0.0 なら不明．
@retval >0 読みこんだヘッダの大きさ (Byte単位)．
@retval 0 ヘッダの区切りを識別できなかった．
@retval JBXL_GRAPH_INVARG_ERROR 不正な引数 (fp, fsize, dsize)
@retval JBXL_GRAPH_MEMORY_ERROR メモリ不足
*/
int jbxl::dicomHeader(FILE* fp, int fsize, int* dsize, int* xsize, int* ysize, int* depth, double* rzxy)
{
int i, j, sz, rp, ef;
int ln, hsize;
int xs = 0, ys = 0, dp = 0;
double rz = 0.0;
#ifdef WIN32
uWord cn[2];
#else
uWord cn[2] __attribute__((may_alias));
#endif
uWord dt;
uWord* wp;
if (fp==NULL || fsize<=0 || dsize==NULL) return JBXL_GRAPH_IVDARG_ERROR;
*dsize = 0;
if (rzxy!=NULL) *rzxy = 0.0;
ef = OFF;
fseek(fp, 0, 0);
/////////////////////////////////////////////////////////////////////
// ヘッダの区切りを検出
rp = (int)fread(&dt, sizeof(uWord), 1, fp);
while(!feof(fp) && ef!=ON) {
//if ((uWord)ntohs(dt)==0xe07f) {
if (dt==DICOM_PIXEL_GROUP) {
rp += (int)fread(&dt, sizeof(uWord), 1, fp);
//if ((uWord)ntohs(dt)==0x1000) {
if (dt==DICOM_PIXEL_ELEMENT) {
rp += (int)fread(&cn, sizeof(uWord), 2, fp);
//if ((uWord)ntohs(cn[0])==0x4f57 && cn[1]==0x0000) {
if (cn[0]==DICOM_PIXCEL_VR && cn[1]==0x0000) {
rp += (int)fread(&cn, sizeof(uWord), 2, fp);
}
//*dsize = *((int*)cn);
int* sizep = (int*)cn;
*dsize = *sizep;
hsize = rp*sizeof(uWord);
if (fsize>=*dsize+hsize) { // footer
ef = ON;
break;
}
}
}
rp += (int)fread(&dt, sizeof(uWord), 1, fp);
}
if (!ef) return 0;
sz = rp*sizeof(uWord);
wp = (uWord*)malloc(sz);
if (wp==NULL) return JBXL_GRAPH_MEMORY_ERROR;
memset(wp, 0, sz);
/////////////////////////////////////////////////////////////////////
// ヘッダ読み込み
fseek(fp, 0, 0);
size_t ret = fread(wp, sz, 1, fp);
if (ret==0) {
return JBXL_FILE_READ_ERROR;
}
for (i=0; i<sz/2-3; i++) {
//if ((uWord)ntohs(wp[i])==0x2800 && (uWord)ntohs(wp[i+1])==0x3000) {
if (wp[i]==DICOM_IMAGE_GROUP) {
// Z方向の歪
if (wp[i+1]==DICOM_PXLSPC_ELEMENT) {
char rx[LNAME], ry[LNAME];
uByte* bp;
memset(rx, 0, LNAME);
memset(ry, 0, LNAME);
if (wp[i+2]==DICOM_STR_VR) ln = wp[i+3];
else ln = *(int*)&wp[i+2];
if (ln<LNAME-1) {
bp = (uByte*)&wp[i+4];
j = 0;
while (j<ln-1 && bp[j]!='\\') {
rx[j] = bp[j];
j++;
}
ln -= j + 1;
bp += j + 1;
j = 0;
while (j<ln-1 && bp[j]!=' ') {
ry[j] = bp[j];
j++;
}
if (!strcmp(rx, ry)) {
rz = atof(rx);
}
}
}
// X サイズ
else if (wp[i+1]==DICOM_XSIZE_ELEMENT) {
if (wp[i+2]==DICOM_INT_VR) ln = wp[i+3];
else ln = *(int*)&wp[i+2];
if (ln==2) {
xs = (int)*(sWord*)&wp[i+4];
}
else if (ln==4) {
xs = *(int*)&wp[i+4];
}
}
// Y サイズ
else if (wp[i+1]==DICOM_YSIZE_ELEMENT) {
if (wp[i+2]==DICOM_INT_VR) ln = wp[i+3];
else ln = *(int*)&wp[i+2];
if (ln==2) {
ys = (int)*(sWord*)&wp[i+4];
}
else if (ln==4) {
ys = *(int*)&wp[i+4];
}
}
// Depth
else if (wp[i+1]==DICOM_DEPTH_ELEMENT) {
if (wp[i+2]==DICOM_INT_VR) ln = wp[i+3];
else ln = *(int*)&wp[i+2];
if (ln==2) {
dp = (int)*(sWord*)&wp[i+4];
}
else if (ln==4) {
dp = *(int*)&wp[i+4];
}
}
}
}
free(wp);
if (rzxy!=NULL) *rzxy = rz;
if (xsize!=NULL) *xsize = xs;
if (ysize!=NULL) *ysize = ys;
if (depth!=NULL) *depth = dp;
return sz;
}
/**
MSGraph<sWord> jbxl::readDicomFile(const char* fn)
DICOM形式のデータを読み込む．
@attention
現在はまだ限定的な機能しか持たない．
@bug depth = 16bit 固定
*/
MSGraph<sWord> jbxl::readDicomFile(const char* fn)
{
int fsize;
FILE* fp;
MSGraph<sWord> vp;
memset(&vp, 0, sizeof(MSGraph<sWord>));
fsize = file_size(fn);
if (fsize<=0) {
vp.xs = JBXL_GRAPH_NOFILE_ERROR;
return vp;
}
if ((fp=fopen(fn,"r"))==NULL) {
vp.xs = JBXL_GRAPH_OPFILE_ERROR;
return vp;
}
vp = readDicomData(fp, fsize);
fclose(fp);
return vp;
}
MSGraph<sWord> jbxl::readDicomData(FILE* fp, int fsize)
{
int sz, dsize;
int xsize, ysize, depth;
double rzxy;
MSGraph<sWord> vp;
memset(&vp, 0, sizeof(MSGraph<sWord>));
sz = dicomHeader(fp, fsize, &dsize, &xsize, &ysize, &depth, &rzxy);
if (sz<=0) {
vp.xs = JBXL_GRAPH_HEADER_ERROR;
return vp;
}
if (dsize!=xsize*ysize*((depth+7)/8)) {
vp.xs = JBXL_GRAPH_HEADER_ERROR;
return vp;
}
if ((depth+7)/8!=2) {
vp.xs = JBXL_GRAPH_HEADER_ERROR;
return vp;
}
vp.set(xsize, ysize, 1, 0, 0, rzxy);
fseek(fp, sz, 0);
size_t ret = fread(vp.gp, dsize, 1, fp);
if (ret==0) vp.xs = JBXL_FILE_READ_ERROR;
return vp;
}
///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
// ファイル名と共通ヘッダによるI/O統合
///////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////////
// ファイル名と共通ヘッダ
/**
CmnHead jbxl::readXHead(const char* fn, CmnHead* chd)
ファイルの Commonヘッダ情報を読み込む．データ本体は読み込まない．
ファイル種別の識別に使用する．
@param fn ヘッダの読み込みを行うファイル名．
@param[out] chd ヘッダ情報を格納する．
@retval 読み込んだグラフィックデータを記述する共通ヘッダ（データ本体は無し）．@n
エラーなら kind=HEADER_ERROR となる．
*/
CmnHead jbxl::readXHead(const char* fn, CmnHead* chd)
{
FILE *fp;
int fsz, csz;
CmnHead hd;
memset(&hd, 0, sizeof(CmnHead));
hd.kind = HEADER_NONE;
fsz = (int)file_size(fn);
if (fsz<=0) {
hd.xsize = JBXL_GRAPH_NOFILE_ERROR;
return hd;
}
///////////////////////////////////////////////////////////////////////
// オペレータ指定のデータ形式を確認（予めヘッダに情報が設定されている）
//
if (chd!=NULL && (chd->kind&0x00ff)==USERSET_DATA) {
if (chd->zsize<=0) chd->zsize = 1;
chd->lsize = chd->xsize*chd->ysize*chd->zsize*((chd->depth+7)/8);
if (fsz==(int)(chd->bsize+chd->lsize)) { // ファイルサイズのチェック
return *chd;
}
}
if ((fp=fopen(fn,"rb"))==NULL) {
hd.xsize = JBXL_GRAPH_OPFILE_ERROR;
return hd;
}
///////////////////////////////////////////////////////////////////////
// 共通ヘッダの読み込み
//
int hsz = sizeof(CmnHead_Entry);
fseek(fp, 0, 0);
size_t ret = fread(&hd.entry, hsz, 1, fp);
hd.buf = NULL;
hd.grptr = NULL;
ntoh_st(&hd, 4);
if (ret==0) {
hd.xsize = JBXL_FILE_READ_ERROR;
hd.kind = HEADER_NONE;
fclose(fp);
return hd;
}
// Sun Raster
if (hd.kind==RAS_MAGIC) {
hd.kind = RAS_DATA;
DEBUG_MODE PRINT_MESG("JBXL::readXHead: Sun Raster File\n");
hd.depth = hd.zsize;
hd.zsize = 1;
hd.lsize = file_size(fn) - sizeof(RasHead);
hd.bsize = 0;
fclose(fp);
return hd;
}
// Common ヘッダ
if (hd.kind > 0 && hd.kind <= NUM_KDATA) {
if (fsz == (int)(hsz + hd.bsize + hd.lsize) + 4 ) hsz = 36; // x86 file
if (fsz == (int)(hsz + hd.bsize + hd.lsize) + 16) hsz = 48; // x64 file
//
if (fsz == (int)(hsz + hd.bsize + hd.lsize)) {
if (hd.zsize<=0) hd.zsize = 1;
if (hd.bsize>0) {
hd.buf = (uByte*)malloc(hd.bsize);
if (hd.buf==NULL) {
free_CmnHead(&hd);
hd.xsize = JBXL_GRAPH_MEMORY_ERROR;
hd.kind = HEADER_NONE;
fclose(fp);
return hd;
}
memset(hd.buf, 0, hd.bsize);
fseek(fp, hsz, 0);
ret = fread(hd.buf, hd.bsize, 1, fp);
ntoh_ar((sWord*)hd.buf, hd.bsize);
hd.grptr = NULL;
if (ret==0) {
hd.xsize = JBXL_FILE_READ_ERROR;
hd.kind = HEADER_NONE;
fclose(fp);
return hd;
}
}
DEBUG_MODE {
PRINT_MESG("JBXL::readXHead: Common ヘッダ\n");
PRINT_MESG("JBXL::readXHead: ヘッダ種別 kind = %d\n", hd.kind);
PRINT_MESG("JBXL::readXHead: ファイルサイズ fsz = %d\n", fsz);
PRINT_MESG("JBXL::readXHead: ヘッダサイズ hsz = %d\n", sizeof(CmnHead_Entry));
PRINT_MESG("JBXL::readXHead: ヘッダバッファ bsize = %d\n", hd.bsize);
PRINT_MESG("JBXL::readXHead: データサイズ lsize = %d\n", hd.lsize);
PRINT_MESG("JBXL::readXHead: サイズ %dx%dx%d %d\n", hd.xsize, hd.ysize, hd.zsize, hd.depth);
}
fclose(fp);
return hd;
}
}
memset(&hd, 0, sizeof(CmnHead));
///////////////////////////////////////////////////////////////////////
// CT File (Moon)
//
CTHead cthd;
csz = sizeof(CTHead);
fseek(fp, 0, 0);
ret = fread(&cthd, csz, 1, fp);
ntoh_st(&cthd, 2);
if (ret==0) {
hd.xsize = JBXL_FILE_READ_ERROR;
hd.kind = HEADER_NONE;
fclose(fp);
return hd;
}
hd.xsize = cthd.xsize - cthd.cutleft - cthd.cutright;
hd.ysize = cthd.ysize - cthd.cutup - cthd.cutdown;
hd.zsize = 1;
hd.depth = 16;
hd.bsize = csz;
hd.lsize = hd.xsize*hd.ysize*hd.zsize*((hd.depth+7)/8);
if (fsz==(int)(hd.bsize+hd.lsize)) {
hd.kind = MOON_DATA;
hd.buf = (uByte*)malloc(csz);
if (hd.buf==NULL) {
free_CmnHead(&hd);
hd.xsize = JBXL_GRAPH_MEMORY_ERROR;
hd.kind = HEADER_NONE;
fclose(fp);
return hd;
}
memcpy(hd.buf, &cthd, csz);
DEBUG_MODE {
PRINT_MESG("JBXL::readXHead: CT ファイル\n");
PRINT_MESG("JBXL::readXHead: ヘッダ種別 kind = %d\n", hd.kind);
PRINT_MESG("JBXL::readXHead: ファイルサイズ fsz = %d\n", fsz);
PRINT_MESG("JBXL::readXHead: ヘッダサイズ hsz = %d\n", sizeof(CmnHead_Entry));
PRINT_MESG("JBXL::readXHead: ヘッダバッファ bsize = %d\n", hd.bsize);
PRINT_MESG("JBXL::readXHead: データサイズ lsize = %d\n", hd.lsize);
PRINT_MESG("JBXL::readXHead: サイズ %dx%dx%d %d\n", hd.xsize, hd.ysize, hd.zsize, hd.depth);
}
fclose(fp);
return hd;
}
memset(&hd, 0, sizeof(CmnHead));
///////////////////////////////////////////////////////////////////////
// Dicom
//
int ls, sz, dsize, xsize, ysize, depth;
double rzxy;
sz = dicomHeader(fp, fsz, &dsize, &xsize, &ysize, &depth, &rzxy);
ls = xsize*ysize*((depth+7)/8);
if (sz>0 && dsize==ls) {
hd.kind = DICOM_DATA;
hd.xsize = xsize;
hd.ysize = ysize;
hd.zsize = 1;
hd.depth = depth;
hd.bsize = sizeof(CTHead);
hd.lsize = ls;
hd.buf = (uByte*)malloc(hd.bsize);
hd.grptr = NULL;
CTHead* pcthd = (CTHead*)hd.buf;
memset(pcthd, 0, hd.bsize);
pcthd->xsize = hd.xsize;
pcthd->ysize = hd.ysize;
if (rzxy>0.0) {
pcthd->anydata[0] = (sWord)(rzxy*RZXY_RATE);
pcthd->anydata[1] = RZXY_RATE;
hd.kind |= HAS_RZXY;
}
fclose(fp);
return hd;
}
///////////////////////////////////////////////////////////////////////
// Well Known ファイル
//
fseek(fp, 0, 0);
Buffer buf = read_Buffer_data(fp, 32);
// TIFF
/*
if (head[0]=='I' && head[1]=='I') {
if (head[2]==0x2a && head[3]==0x00) {
DEBUG_MODE PRINT_MESG("JBXL::readXHead: TIFFデータ形式\n");
hd.kind = TIFF_DATA;
fclose(fp);
return hd;
}
}
if (head[0]=='M' && head[1]=='M') {
if (head[2]==0x00 && head[3]==0x2a) {
DEBUG_MODE PRINT_MESG("JBXL::readXHead: TIFFデータ形式\n");
hd.kind = TIFF_DATA;
fclose(fp);
return hd;
}
}*/
#ifdef ENABLE_JPEGLIB
// JPEG
if (isJPEGHeader(buf)) {
DEBUG_MODE PRINT_MESG("JBXL::readXHead: JPEGデータ形式\n");
hd.kind = JPEG_RGB_DATA; // JPEG_RGB_DATA or JPEG_MONO_DATA
free_Buffer(&buf);
fclose(fp);
return hd;
}
#endif
free_Buffer(&buf);
///////////////////////////////////////////////////////////////////////
// Another Unknown File Format
//
DEBUG_MODE PRINT_MESG("JBXL::readXHead: 未知のデータ形式\n");
memset(&hd, 0, sizeof(CmnHead));
hd.kind = UN_KNOWN_DATA;
hd.lsize = fsz;
fclose(fp);
return hd;
}
/**
CmnHead jbxl::readXHeadFile(const char* fn, CmnHead* chd, bool cnt=false)
データ種別を自動判定して，グラフィックデータを読み込み，Common 形式に変換する．
USERSET_DATAの場合は chd を指定する．また chdの kind にはオプションの情報も入れられる（現在はエンディアンのみ）
サポートしているデータ形式は,
- Common 形式 : Common 形式にしたがって読み込む．(CT_RGN_SLは未サポート)
- Sun Raster : Common 形式に変換する．ヘッダは RAS_DATA になる
- Moon(CT) : Common 形式に変換する．ヘッダは MOON_DATA になる．
- DICOM : Common 形式に変換する．512x512xZ固定．ヘッダは DICOM_DATAになる．
- USERSET_DATA : CmnHead* chd でヘッダ情報を指定して，読み込みを行う．ヘッダは USERSET_DATAになる．
- Unkonwn : ファイルをそのまま，hd->grptrへ読み込む．ヘッダは UN_KNOWN_DATA になる．
ただし，UN_KNOWN_DATAの場合は CmnHaedの hd->kind, hd->lsize(ファイル長), hd->gptrのみ有効．
@param fn 読み込むを行うファイル名．
@param[in,out] chd USERSET_DATA指定の場合，ファイルのヘッダ情報を入れる．@n
またはファイルに関するオプション情報も指定できる（現在はエンディアンの情報のみ）．
@param cnt 仮想カウンタを使用するか？
@return 読み込んだグラフィックデータを記述する共通ヘッダ．@n
エラーなら kind = HEADER_NONE となる．またエラーの種類により xsizeが変化する．
@retval JBXL_GRAPH_OPFILE_ERROR @b xsize ファイルオープンエラー．
@retval JBXL_GRAPH_MEMORY_ERROR @b xsize メモリエラー．
@retval JBXL_GRAPH_CANCEL @b xsize キャンセル by ユーザ
@bug Common形式の画素深度が 24,32bitの場合のエンディアン処理が未実装
*/
CmnHead jbxl::readXHeadFile(const char* fn, CmnHead* chd, bool cnt)
{
FILE* fp;
int fsz;
bool no_ntoh = false;
CmnHead hd;
CVCounter* counter = NULL;
memset(&hd, 0, sizeof(CmnHead));
hd.kind = HEADER_NONE;
fsz = (int)file_size(fn);
if (fsz==0) {
hd.xsize = JBXL_GRAPH_NOFILE_ERROR;
return hd;
}
if ((fp=fopen(fn,"rb"))==NULL) {
hd.xsize = JBXL_GRAPH_OPFILE_ERROR;
return hd;
}
///////////////////////////////////////////////////////////////////////
// オペレータ指定のデータ形式を確認（予めヘッダに情報が設定されている）
//
if (chd!=NULL) {