locodox_python/env_developpement2.txt at main · CKermabon/locodox_python · GitHub

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Installer jupyter-notebook/etc dans l’environnement conda de base
conda activate base
conda install jupyter
⇒ A utiliser juste pour lancer jupyter-lab/notebook/ etc.
Lancer tout le temps le même jupyter-lab/jupyter-notebook.
Inutile d’en avoir plusieurs d’installés. L’essentiel est que l’environnement conda/python soit visible de ce jupyter.

Dans .cshrc, conda activate base (pour activer env conda de base)
Dans .condarc (debase et/ou de l'environnement en cours), enlever le channel defaults. Ne garder que le channel conda-forge

Creation environnement de developpement :
conda create -n locodox_env python=3.10

Activation de l’environnement :
A activer uniquement pour installer module/package
conda activate locodox_env
conda list (pour voir ce qui est installé)

Verification de la version de python dans l’environnement activé :
python –version (Python 3.10.13 dans locodox_env)

Verifier que le fichier kernel.json ainsi créé est correct 'ie que le python utilisé est bien celui de l'environnement (/Users/chemon/Library/Jupyter/kernels/locodox_env/kernel.json)

conda install -c conda-forge xarray dask netCDF4 bottleneck
conda install ipykernel (indique que l’on souhaite que cet environnement soit accessible de jupyter)

#Rajouter cet environnement dans les noyaux accessibles de jupyter-notebook :
#python -m ipykernel install --user –name=’locodox_env’
python -m ipykernel install --name locodox_env --user

Ajout de librairies :
conda install scipy -c conda-forge
conda install argopy -c conda-forge
conda install matplotlib -c conda-forge
conda install seawater -c conda-forge
conda install cartopy -c conda-forge

Pour ne pas utiliser le channels defaults (desormais payant), ni les channels du fichier .condarc, il faut faire :

conda install matplotlib -c conda-forge –-override-channels

Pour pouvoir faire des zooms sur les plots, il semble qu'il faille installer ipympl ET dans l'environnement de base (d'où l'on prend le jupyter-lab) ET dans l'environnement de travail (locodox_env). L'installation est faite dans les 2 environnements par : conda install -c conda-forge ipympl


Environnement avec uniquement conda-forge (car le channels defaults est désormais payant) :

conda create --name locodox_conda_forge python=3.10 --channel conda-forge –override-channels

conda config --env --add channels conda-forge

conda config --env --remove channels defaults (mais ca semble ne pas marcher car defaults est toujours dans les channels)
Il est préférable de modifier manuellement le fichier .condarc du répertoire de l'environnement (locodox_conda_forge), n'autoriser que conda_forge dans les channels

conda config --env --set channel_priority strict

conda config –-show

conda install matplotlib -c conda-forge --override-channels
conda install scipy -c conda-forge --override-channels
conda install argopy -c conda-forge –-override-channels
conda install seawater -c conda-forge –-override-channels
conda install cartopy -c conda-forge –-override-channels
conda install ipykernel -c conda-forge –-override-channels
python -m ipykernel install --user --name 'locodox_conda_forge'
conda install -c conda-forge ipympl –-override-channels
conda install -c conda-forge dask –-override-channels
conda install -c conda-forge scikit-learn
pip install pwlf